Plant Cell Lab - Plantecellelaboratoriet

Plantecellelaboratoriet ved Biovit er et forskningslaboratorium for forskning og undervisning utført av forskningsgruppene innen plantebiologi.

Kontaktinfo

E-post: Manikandan Veerabagu

Telefon: 67232631

Besøk- og postadresser

Åpningstider

Kl 08:00 - 15:45

15. mai - 14. september:
Kl 08:00 - 15:00

Velkommen til å utføre din forskning i Plantecellelaben

Kontakt: Lab koorinator Manikandan Veerabagu 67232631
Besøksadresse : Kirkeveien 16 A, 1433 Ås

Arbeidsområder og laboratorieanalyser

Celle- og vevskultur innen planter
Molekylærbiologi (gensekvenser og gentranskriptsekvenser, analyse av genuttrykk, kopinummer-variasjon (CNV), in situ hybridisering og annet standard molekylærarbeid.)
Protein (Western Blot analyser, ELISA)
Cellebiologi (Preparering for mikroskopanalyser, immunlokalisering, lys-mikroskopi)
Biokjemiske analyser (karbohydrater, enzymer (Katalase, SOD etc), antioksidanter, pigmenter og andre metabolitter.
Transgene organismer (lage og arbeide med GMO, genredigering/CRISPR)

Undervisning i Plantecellelaben
Plantecellelaben brukes til mange kurs innen plantebioteknologi. Det er 200 og 300 kurs som er avhengig av fasilitetene og instrumentene i laboratoriet.
Master- og PhD-studenter benytter laben i deres prosjekter innen plantebioteknologi og plantebiologi.
Laben brukes også til forberedelse/tillaging for studentkurs innen plantefysiologi og genetikk.

Instrumenter og utstyr/infrastruktur

Celle- og vevskultur
Utstyr for tilbereding av næringsmedium, blant annet:
Sterilizer GE666 EC-1, Getinge. Autoklav.
Milli-Q IQ 7000, Merck Millipore. Ultrarent type 1 vann.
Sterilrom (4)
Produktbeskyttende sterilbenker (LAF)(8) og Sikkerhetsbenk (LAF)(1).
Rommene er godkjent for arbeid med GMO inneslutningsnivå 2.
Vekst-rom for celle- og vevskultur (3)
Lys 20°C. Lys 23°C. Mørkt 23°C.
Bioreaktorer (6)
6 x 2 liter
Instrumenter - mikroskop
Lysmikroskop
Leica DM 5000B fluorescens med kamera (Leica MC190 HD) tilknyttet PC med (bilde-analyseprogram LAS 4.13) programvare LAS 4.13, manuell multifokus.
Fluorescens filtre: UV(A), Blå(I3), Grønn(N2).
To gamle mikroskop; normalt (1) og invert (1) for flytende vevskultur.
Stereomikroskopi
Leica M205 med automatisk multifokus og kamera/programvare som DM 5000B.
Leica MZFLIII fluorescens med kamera/programvare som DM 5000B.
Fluorescens filter: UV, GFP2 (Pluss fluorescens), GFP3 (Plant fluorescens)
Vanlige manuelle stereomikroskop (10).
Instrumenter – molekylærbiologi
Bioanalyzer
2100 bioanalyzer, Aglient. Sjekke kvaliteten på RNA/DNA, også kvantitet.
Bioanalyzer
(Photo: Aglient Technologies)
PCR systemer
7500 Fast Real-Time PCR System, Applied Biosystem. Kvantitativ PCR.
C1000 Touch Thermal Cycler, BioRad. Endepunkt PCR, mulig å kjøre gradient PCR.
T100 Thermal Cycler, BioRad. Endepunkt PCR, kapasitet til å kjøre gradient PCR (2).
QPCR
(Photo: Thermo Fisher Scientific)
QX200 Droplet Digital PCR (ddPCR), BioRad.
Applikasjoner som genuttrykk, CRISPR analyser, kopinummervariasjon (CNV), påvise mutasjoner etc.
ddPCR
(Photo: Bio Rad Laboratories)
Proteiner
Protein elektroforese. Mini-PROTEAN, BioRad.
Western Blot. Trans-Blot Turbo transfer system, BioRad. Rask overføring fra gel til blotting papir.
Dokumenterings-utstyr
Chemi-Doc MP, BioRad.
Ta bilde av geler og Western Blot. Multipleks fluorescens for western blot, kjemiluminescens analyse/deteksjon, gel-dokumentasjon, «stain-free» teknologi.
Chemi-Doc MP
(Photo: Bio Rad Laboratories)
Fluorometer
Qubit assays, Life.
Eksakt kvantifisering av DNA, RNA og protein. Det er nødvendig med «assay kits» med stadandarder.
Qubit
Foto: Life Technologies
Instrumenter - spektrofotometere
Multiscan SkyHigh Microplate Reader, ThermoFisher.200-1000 nm.
Mikroplater, kyvetter og µDrop Duo Plates (2-10 µl, 32 prøver).
Absorbans og turbiditet – endepunkt, kinetikk eller spekter-skanning.
Fra romtemperatur til 45 °C, mulighet for risting av mikroplate.
Analyse av DNA, RNA og protein.
Nano Drop One, Thermo Scientific. UV og synlig spektrofotometer.
Konsentrasjon og renhet av DNA/RNA.
NanoDrop
(Photo: Thermo Fisher Scientific)
Helios-α, UNICAM. For kyvetter. UV- og synlig lys.
Instrumenter – frysetørker
LyoQuest -55, Telstar; med standard kammer.
Kondensator-kapasitet is 5 kg/24 h.
Freeze drier
(Photo: Telstar)
Diverse instrumenter
Rotavapor og speed vakuum konsentrator.
Rotavapor R210 og Vacuum Controller V850, Buchi.
Speed vacuum concentrator SC210A og Savant RVT 400 Refrigator Vapor Trap, Thermo Scientific.
Presisjons-vekt
Excellence Plus XP, Mettler Toledo.
Måle-område: 1 µg – 6 g.

Infiltrering- og innstøpings-utstyr/instrumenter for parafinvoks
Tissue-Tek VIP 5 Jr, Sakura. Vakuum infiltreringsprosessor for parafinvoks.
Tissue-Tek TEC 5, Sakura. System for innstøping av vev I parafinvoks.

Tissue-Tek TEC
(Photo: Sakura)

Tissue-Tek Tek
(Photo: Sakura)