Timothy

Genomikk, populasjonsgenetikk og maskinlæring for å oppdage genetiske endringer og identifisere gener som er involvert i fryse- og isingstoleranse, og for å forutsi bedre timoteisorter.

Om prosjektet

Seleksjon vil raksere gi nye forbedrede og mer robuste timoteisorter, gjøre grasbasert landbruk mer bærekraftig og forbedre konkurranseevnen til Graminor-sortene. Ny kunnskap om tilpasning av timoteisorter vil øke avlingsstabiliteten og gjøre grovfôrproduksjonen mer robust. Dette er spesielt viktig for bønder i Nord-Norge, der vinterskader er et økende problem. Frøfirmaer vil ha nytte av informasjon om hvordan de kan sikre unike sortenegenskaper under frøformering av sorter.

Identifisering av mer robuste sorter med bedre vinteroverlevelse i et klima i endring vil øke overlevelsen av kortvarig eng og engarealer. Dette vil redusere behovet for reetablering av enger på grunn av vinterskader, noe som vil resultere i sterkt reduserte karbonutslipp fra enger. Prosjektet støtter opp om flere av FNs bærekraftsmål.

Mål

Hovedmålsetting: Å fremskaffe nødvendig kunnskap og verktøy for en mer effektiv og sikker foredling og oppformering av timoteisorter, spesielt for Nord-Norge.

Subgoals:
1) Clarify the risk for genetic shifts, especially in characters related to winter har

Delmål:

  1. Avklare risikoen for genetiske endringer, spesielt i karakterer knyttet til vinterherdighet, og dermed utvikle retningslinjer for trygg, men effektiv frøformering av syntetiske timoteisorter og andre åpenpollinerte fôrgras for nordlige områder.
  2. Generere et utkast til genomet til timotei ved hjelp av sekvenseringsteknologier med lange avlesninger og avanserte bioinformatikkprogrammer.
  3. Bruke genotyping ved sekvensering (GBS) for å utvikle SNP-markører for molekylær foredling av timotei og sporing av allelfrekvensendringer over generasjoner.
  4. Studere differensielt uttrykk av gener som er involvert i frost- og isingstoleranse ved hjelp av RNA-sekvensering.
  5. Utvikle nye prediksjonsmodeller ved å implementere historiske klimadata, jorddata og fenotypedata ved hjelp av avanserte maskinlæringsmodeller for å utvikle robuste sorter.

Deltakere

Odd Arne Rognli

Odd Arne Rognli

Professor emeritus

Prosjektleder

Eksterne deltakere

Muath Alsheikh
R&D Leader & Breeder, Graminor

Helga Amdahl
Breeder (Forage Crops), Graminor

Susanne Windju
Molecular Breeder, Graminor

Kristin Håland Gylstrøm
Assistant Breeder (Forage Crops) Graminor

Sigridur Dalmannsdottir
Research Scientist, NIBIO, Holt

Marit Jørgensen
NIBIO, Holt

Trygve S. Aamlid
Senior research Scientist, NIBIO, Landvik

Therese Mæland
Research Scientist, NIBIO, Særheim

Kristoffer Herland
Senior researcher, Norsk Regnesentral

Thordis L. Thorarinsdottir
Chief Research Scientist, Norsk Regnesentral