BIN420 Bioinformatikk for funksjonell meta-omikk
Studiepoeng:5
Ansvarlig fakultet:Fakultet for kjemi, bioteknologi og matvitenskap
Emneansvarlig:Torgeir Rhodén Hvidsten
Campus / nettbasert:Undervises campus Ås
Undervisningens språk:Engelsk
Antall plasser:15
Frekvens: Undervises i desember 2024. Deretter: kontakt emneansvarlig.
Forventet arbeidsmengde: Forelesninger 10 timer Computer øvinger 25 timer Selvstudium 90 timer
Undervisnings- og vurderingsperiode:Høstparallell
Om dette emnet
Dette lærer du
KUNNSKAP
- Evne til å designe eksperimenter og velge passende metoder og programvare
- Forklare populasjonsstrukturen i et mikrobielt samfunn
FERDIGHETER
- Utføre og vurdere assembly og taksonomisk gruppering og tolke resultatene
- Kombinere data fra ulike omikk-teknologier med tanke på funksjon hos det mikrobielle samfunnet
GENERELL KOMPETANSE
- Forklare og forstå hva som er begrensingene i metodene
Intensivt emne over en uke, samt en prosjektrapport som skrives i etterkant. Hver undervisningsdag består av:
- to en-timers forelesninger
- en fem-timers computer-lab under veiledning
- Canvas
- Vil spesifiseres ved emnets start
Master i bioinformatikk, eller beslektet tema.
Må kunne UNIX på brukernivå og ha kjennskap til programmering (Python og/eller R).
Grunnleggende kjennskap til mikrobiologi er også nødvendig.
- Et prosjekt der hver student leverer en skriftlig oppgave (teller 100 %).
Oppgave Karakterregel: Bestått/ Ikke bestått - Rapportene vil evalueres av en ekstern sensor
En uke undervisning:
- 2 forelesninger per dag (1 time hver)
- 1 dataøving per dag (5 timer)
- Realfag