Målet med doktorgradsarbeidet til Dat Thanh Nguyen har vært å skape mer nøyaktige, effektive og skalerbare verktøy for å koble genetiske variasjoner til hvordan gener styres, spesielt i de ikke-kodende delene av genomet.
Doktorgradsarbeidet til Dat Thanh Nguyen har handlet om å utvikle bedre metoder for å forstå hvordan de mange genetiske forskjellene vi ser mellom individer hos mennesker og dyr faktisk påvirker viktige egenskaper, som for eksempel vekst eller helse. Selv om det er millioner av slike forskjeller, er det bare noen få som har reell betydning. Forskningen har fokusert på de delene av DNA-et som ikke er oppskrifter på proteiner, men som likevel kan ha evnen til å styre hvordan gener fungerer – et område som er vanskelig å tolke.
Det viktigste resultatet er utviklingen av nye dataverktøy som hjelper forskere med å finne frem til de genetiske endringene som har en effekt på hvordan organismen fungerer på et molekylært nivå. Ett verktøy forbedrer analysen av sirkulært RNA, en type RNA som er viktig i genregulering, noe som gjør det lettere å finne genetiske variasjoner som påvirker denne RNA-typen. Et annet verktøy gjør det mulig å finne koblinger mellom genetiske varianter og molekylær data selv med data fra få individer, noe som er nyttig for å redusere kostnaden på slike eksperimenter. Et tredje verktøy bruker kunstig intelligens for å forutsi hvordan DNA-endringer kan påvirke genreguleringen hos husdyr og fisk.
Målet med arbeidet har vært å skape mer nøyaktige, effektive og skalerbare verktøy for å koble genetiske variasjoner til hvordan gener styres, spesielt i de ikke-kodende delene av genomet. Dette er viktig fordi mange av de genetiske forskjellene som påvirker viktige egenskaper i landbruk og akvakultur finnes nettopp her.
Ved å bli bedre til å finne og forstå disse genetiske signalene, kan denne forskningen ha stor betydning for avl og forbedring av husdyr og oppdrettsfisk. Det kan gi oppdrettere et bedre grunnlag for å velge ut de dyrene som har de mest ønskede egenskapene, for eksempel bedre helse, raskere vekst eller økt produksjon. På sikt kan dette bidra til en mer effektiv og bærekraftig matproduksjon. I tillegg kan kunnskapen som genereres også ha overføringsverdi til medisinsk forskning og forståelse av sykdommer hos dyr og mennesker.
Dat Thanh Nguyen forsvarer sin avhandling "Forbedrede beregningsmetoder for regulatorisk genomisk inferens" 22. april 2025.
Hovedveileder har vært Dr. Lars Grønvold. Medveieldere Prof. Simen Rød Sandve og Prof. Sigbjørn Lien