Samarbeid om EU-prosjekter på tvers av fagmiljøer ved NMBU

Forskningsprosjektene sorterer under EUs Horizon 2020-paraply. De har fått navnene HoloRuminant og 3D-omics. 

– Begge prosjektene driver med forskning i det nye fagfeltet hologenomics. Her studeres vert (ku, gris, sau) og samfunnet av mikrober som lever på og i verten, som ett, holistisk system, forklarer Torgeir Hvidsten.

Forskerne skal blant annet se på hvordan slike systemer endrer seg når man bruker fôr laget av ulike ingredienser, gjennom å generere store genomikk-datasett og analysere disse.

Felles innsats i praksis

Det er mye å hente på at forskere fra ulike fagmiljøer ved NMBU samarbeider.

– BIOVIT og SHF er gode på husdyr (verten), og på KBM er vi gode på mikrobiota, fôr-ingredienser og datanalyse, forteller Hvidsten.

– Vi er veldig glade for denne typen samarbeid med andre fakulteter og sentre ved NMBU, sier KBM-dekan Sigrid Gåseidnes.

– Samspill og fellesskap er én av NMBUs definerte verdier og her ser vi virkelig gode eksempler på hvordan ulike fagmiljøer er med på å spille hverandre gode. Dette er «Felles innsats for en bærekraftig fremtid» i praksis, sier hun.  

Også BIOVIT-dekan Kari Kolstad er glad for samarbeidet:

– Vår jobb som dekaner og senterledere er å legge til rette for samarbeid mellom dyktige folk på tvers av fakultetene på NMBU. Slik får vi til de virkelige store faglige satsningene som setter NMBU på kartet. Disse prosjektsamarbeidene er eksempler på dette. Og flere vil det bli med våre dyktige forskere i kombinasjon med løsningsorienterte dekaner!

Tverrfaglig forskning

3D-omics koordineres ved KBM og HoloRuminant ved BIOVIT.

– Ettersom vi allerede er fordelt på flere fakulteter, har vi et godt grunnlag for en tverrfaglig struktur på forskning og organisering, sier Phil Pope, førsteamanuensis ved BIOVIT og leder for MEMO-gruppen (Microbial Ecology and Meta-Omics). Han jobber for øvrig også 20 prosent ved KBM, hvor han er del av forskningsgruppen PEP - The Protein Engineering and Proteomics Group.

Flere NMBU-prosjekter tilknyttet forskningsgruppene MEMO og PEP skal også kobles opp mot EU-prosjektene. Det gjelder blant annet Live Heldal Hagens SeaCow og Phil Popes SuPAcow, som vil samarbeide med HoloRuminant-prosjektet. KBMs ledende kompetanse og infrastruktur innen metaproteomikk, som både NMBU og NFR har investert i, er viktig for disse prosjektene.

MEMO-gruppen består allerede av forskere på tvers av flere fakulteter og fagmiljøer ved NMBU, og har en tverrfaglig tilnærming til å studere mikrobiomer i fordøyelsessystemer.  

Langsiktig forskningssamarbeid

– Ekte, multi-disiplinært samarbeid er nødvendige for å håndtere de store spørsmålene, som å forstå, observere og manipulere komplekse mikrobiomer som påvirker produksjonsdyr. Dette inkluderer for eksempel grunnleggende mikrobiologi og fysiologi, molekylær mikrobiologi, analytisk kjemi, husdyrhold og ernæring, bioinformatikk og biostatistikk. Denne helhetlige tilnærming var en svært viktig del av prosjektsøknaden, sier Pope.

Han forteller at arbeidet med EU-prosjektene bygger på flere år med forskningssamarbeid.

– De siste fire årene har Torgeir Hvidsten, Simen Sandve og jeg jobbet sammen om å utvikle arbeidet vårt i “holo-genomics”-feltet.

– Vi har fokusert på å integrere omic-data hentet fra verts-mikrobiomer, som vi nå kan se på som en serie dynamiske koblinger mellom vertens arvemateriale, mikrobiomets funksjoner, påvirkninger mellom verten og miljøet, og vertens genetiske egenskaper, sier Pope.